As moléculas de polímero de borracha de silicone são estruturas em forma de cadeia formadas por ligações Si-O (silício-oxigênio), e seu componente principal é o polissiloxano linear de alta massa molar. Como a ligação Si-O-Si é seu tipo de ligação básica, os átomos de silício são principalmente conectados a grupos metil e uma quantidade muito pequena de grupos insaturados são introduzidos nas cadeias laterais.
As forças intermoleculares são pequenas e as moléculas têm uma estrutura helicoidal. Os grupos metil são dispostos para fora e podem girar livremente, o que faz com que a borracha de silicone tenha melhor resistência ao calor, isolamento elétrico, estabilidade química etc. do que outras borrachas comuns.
A borracha de silicone típica, a saber, a polidiformaldeído siloxano, possui uma configuração molecular helicoidal com forças intermoleculares relativamente pequenas, possuindo excelente resiliência. Enquanto isso, os grupos de formaldeído apontando para fora da hélice podem girar livremente, que dona de borracha de silicone com propriedades de superfície exclusivas, como hidrofobicidade e superfície não-esticável